生徒と先生という関係を気にしなければ、M.Sさんはどうしたいですか?
付き合いたいのなら
確かに先生と生徒で関係を持つということは問題がありますね。 でも、お互いが学校は学校、プライベートはプライベートと切り替えがしっかり出来るのであれば、付き合ってもいいかと思います。ですが相手はまだ中学生です、あなたから見て彼は出来ると思いますか?また、あなたも出来る自信はありますか? もし片方でも出来ないと思うのであれば、まだ付き合わずに彼が高校生になってから付き合うのがよろしいかと思います。高校生になれば自己も確立しますし、その頃でも彼があなたのことを想っているのであれば、彼が本気だということがはっきりとしますし。
付き合わないのなら
先生なら先生らしく、仕事の邪魔をしたり、目上の人にする行動ではないことをしている生徒を、しっかりと叱ってください。それでも止まないようなら、生徒の親に相談するなどの行動をしてみてください。 それでも止まなければ、その生徒と距離を置いた方がいいのかと思います。 難しいかもしれませんが、一指導者として頑張ってください。
どちらにせよ、相手とあなたの関係がよくなることを応援しています。